- Alleluja
- Cantate Domino canticum novum, BuxWV 12
- Ciacona for Organ in C minor, BuxWV 159
- Durch Adams Fall ist ganz verderbt
- Eins bitte ich vom Herrn, BuxWV 24
- Erhalt uns, Herr, bei deinem Wort
- Fugues for Organ, BuxWV 174-176
- Gamba Sonata
- Herr Jesu Christ, ich weiss gar wohl
- Ihr lieben Christen, freut euch nun, BuxWV 51
- Laudate, pueri Dominum
- Mit Fried und Freud, BuxWV 76
- Nun bitten wir den heiligen Geist, BuxWV 208
- Nun bitten wir den heiligen Geist
- Other Major Organ Works